Le Conseil de l'Institut - désigné par le Conseil fédéral - est, pour ce qui est de la gestion de l'IPI, la plus haute instance dirigeante de l'Institut.

• Corina Eichenberger-Walther, avocate et médiatrice, présidente du Conseil de l’Institut, nommée jusqu'au 31.12.2027
• Caroline Perriard, licenciée en droit, director Data Protection & Privacy chez BRP Bizzozero & Partners SA, nommée jusqu'au 31.12.2027
• Luc-E. Amgwerd, licencié en droit, co-fondateur de Gjosa SA, vice-président du Conseil de l'Institut, nommé jusqu'au 31.12.2027
• Daniela Marino, docteure en sciences, directrice générale de CUTISS AG, nommée jusqu'au 31.12.2027
• Peter Walser, docteur en sciences naturelles EPF, conseil en brevets,  nommé jusqu'au 31.12.2027
• Evelyn Zwick, physicienne diplômée EPF, conseil en brevets, nommée jusqu'au 31.12.2027